Chùa Cống Yên còn gọi là chùa Kho than, toạ lạc tại xóm Vĩnh Phúc 1, phường Vĩnh Phúc, quận Ba Đình. Chùa được xây dựng cách đây khoảng hơn 100 năm, mặt bằng bao gồm: khu thờ chính, nhà thờ tổ, đền thờ Thánh mẫu và khu nhà ở của các sư, vãi. Hiện chùa còn giữ được một tấm bia đá được làm vào ngày 25/10 năm thứ 8, triều Khải Định. Bia cao 1,1m, rộng 0,8m, xung quanh có trang trí hoa văn, ghi lại tên tuổi của những người dân ở trong làng đã góp tiền, góp ruộng cho chùa. Ngoài ra, bia còn ghi lại những điều ước, những quy định cụ thể của chùa. Trên xà chéo ở phía bên trái của hiên, hiện còn treo một quả chuông đồng. Chuông cao khoảng 80cm, đường kính rộng 40cm, miệng loe, trên thân chuông có hoa văn trang trí nổi, có chạm khắc hình rồng, mây. Toàn thân được chia thành 4 phần bởi những đường đúc nổi. Trong mỗi phần đó, ở sát phía trên nóc có khắc nổi một chữ Hán, tạo thành 4 chữ “Phúc An tự chung”, quai đeo của chuông là hình chạm khắc thân một con rồng có hai đầu, giương vây, 4 chân bám xuống đỉnh chuông.
Tại góc trái có hai bộ khám thờ: một khám thờ Trần Hưng Đạo và một khám thờ vị sư trước đã nhiều năm trụ trì ở chùa này. Những tấm bia bên trái là bia “Phúc An ký tự”, “Hậu phật bi ký”, “Ký ky bi ký” đều được làm vào năm thứ 10 triều Khải Định và năm thứ 16 triều Bảo Đại. Ngay dưới những tấm bia này là bệ thờ tổ sư, ở đây có ba pho tượng. Hai pho tượng ở hai bên đầu trần, mặc áo chùng, ngồi xếp bằng tay đặt lên đùi, ở giữa là một pho tượng nhỏ bằng đá. Phía đối diện và vuông góc với bệ thờ tổ sư là nơi thờ Thánh mẫu. Khu này gồm có 7 pho tượng, chia thành ba lớp. Lớp trong cùng là tượng ba vị Thánh mẫu: Mẫu Liễu Hạnh, Mẫu Thượng Ngàn, Mẫu Thủy Tiên.
Trong điện thờ được bố trí bốn tầng tượng Phật. Tầng trong cùng là ba vị tam thế, tầng thứ hai có tượng Thích Ca, tầng thứ ba ở chính giữa là pho tượng Phật to nhất ở chùa. Tầng thứ tư là tượng Cửu Long, bên trái có hai tượng đội mũ bình thiên, tay cầm hốt, bên phải còn một pho tượng nữa. 
Ngoài ra, giữa vườn cây còn có khu vực đặt hài cốt của các nhà sư đã trụ trì ở chùa này. Theo phong tục, cứ đến ngày rằm và mùng một, đặc biệt là bốn lần tế, lễ chính, người dân làng Vĩnh Phúc lại nô nức đến chùa Cống Yên sắm lễ cúng Phật, tại đây họ tìm thấy sự thanh bình, yên tĩnh và cầu mong mưa thuận, gió hòa để cuộc sống ngày càng tốt đẹp hơn.